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Science:科学家成功构建肿瘤浸润T细胞的泛癌单细胞图谱
[ 来源:转载自网络   发布日期:2021-12-29 09:54:07  责任编辑:  浏览次 ]

靶向肿瘤特异性T细胞的癌症免疫疗法已使许多癌症患者受益,但是针对不同类型的癌症的临床疗效差异很大。肿瘤浸润T细胞经常进入功能失调状态,这一现象被广泛称为T细胞衰竭(T cell exhaustion),而效应T细胞的抗肿瘤功能受多种因素调节,包括调节性T细胞(Treg细胞)的存在。T细胞的状态和丰度在不同癌症类型的肿瘤微环境(TME)中有所不同,这可能从根本上影响不同的临床参数,如对免疫疗法的药物反应。

在一项新的研究中,为了建立一种高分辨率的泛癌T细胞图谱,来自中国北京大学的研究人员对各种癌症类型的患者的肿瘤、癌旁组织和血液样本进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq),并收集了其他已发表的scRNA-seq数据集。在校正了混杂因素和批次效应后,对这些不同的数据进行了整合。该图谱由21种癌症类型的316名患者的scRNA-seq数据组成。将T细胞表面上的T细胞受体(TCR)序列与基因表达谱组合起来,以描述T细胞的扩增和动态。应用各种计算方法来研究不同癌症类型的T细胞的特征和丰度。相关研究结果发表在2021年12月17日的Science期刊上,论文标题为“Pan-cancer single-cell landscape of tumor-infiltrating T cells”。

这些编辑在癌症患者中发现了多种潜在的肿瘤反应性T细胞(pTRT)群体,在不同类型的癌症的肿瘤微环境中,pTRT的状态有很大的不同。对于CD8+T细胞而言,主要的pTRT是功能衰竭的T细胞,并表现出高度的异质性。他们通过计算推断出T细胞衰竭的两条主要发展路径,分别是通过效应记忆T细胞和组织驻留记忆T细胞,而且这两条路径在不同的癌症类型中都很普遍。他们还注意到末端衰竭的T细胞与自然杀伤(NK)样T细胞、17型CD8+T细胞(Tc17细胞)细胞和CD8+Treg细胞等细胞之间的状态转换,但这类转换往往发生在特定的癌症类型中。

对于CD4+T细胞而言,TFH/TH1双功能T细胞似乎起源于TFH细胞,也是值得注意的pTRT,并与肿瘤突变负荷相关联。他们还发现,pTRT的转录程序可以受到肿瘤微环境中TGF-β和干扰素的影响。T细胞状态的丰度因癌症类型的不同而有很大的差异。基于肿瘤浸润T细胞的组成,癌症患者可以被免疫分型为一组具有高频率的终末衰竭CD8+T细胞和另一组具有高频率的组织驻留记忆CD8+T细胞,并且免疫类型与临床特征相关,如患者的生存率和对免疫检查点阻断的反应。

综上所述,这些编辑描绘了肿瘤微环境中T细胞异质性和动态的泛癌景观,并为未来与癌症治疗相关的时间或空间研究建立了一个基线参考。对不同癌症类型的系统比较揭示了不同肿瘤微环境中T细胞状态的共性和差异。他们对肿瘤浸润T细胞的详细特征、动态和调控的揭示将促进免疫疗法的开发,而且他们提出的免疫分型可以有助于靶向T细胞的治疗和诊断策略。

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